Albero

Newick: raggruppa le specie affini tra parentesi; aggiungi :0.5 dopo un nome per la lunghezza del ramo. Oppure elenca le specie, una per riga.

Newick

Generatore di cladogrammi

Scrivi una lista di specie o un gruppo annidato con le parentesi e questo generatore di cladogrammi disegna subito il diagramma ramificato: ogni organismo sulla propria punta, ogni antenato condiviso su un nodo, pronto da scaricare in PNG o SVG. È pensato per le lezioni di biologia, dove la domanda di solito è chi è più strettamente imparentato con chi, non quanti milioni di anni fa si sono separati.

Che cosa mostra un cladogramma

Un cladogramma è un’ipotesi sulle relazioni evolutive. Leggendo dalla radice, ogni nodo è l’antenato comune più recente di tutto ciò che sta alla sua destra, e il gruppo che discende da un nodo è un clade. Due specie che si uniscono in un nodo vicino alle punte sono parenti stretti; una specie il cui ramo lascia il tronco per primo è il gruppo esterno. Le lunghezze dei rami qui non hanno significato, conta solo l’ordine delle divisioni, ed è per questo che un cladogramma può essere ridisegnato con qualsiasi spaziatura senza cambiare ciò che dice.

Caratteri derivati condivisi

I biologi collocano gli organismi su un cladogramma in base ai caratteri che condividono con un antenato comune ma non con i lignaggi precedenti, chiamati caratteri derivati condivisi o sinapomorfie. L’albero di esempio fa esattamente questo per i vertebrati: la lampreda si stacca per prima perché non ha mascelle; lo squalo ha le mascelle ma non uno scheletro osseo; il salmone aggiunge l’osso; la lucertola aggiunge quattro arti e un uovo con il guscio; e il topo e l’uomo stanno insieme sull’ultimo nodo perché entrambi hanno il pelo e allattano i piccoli. Ogni carattere compare una volta sola, nel nodo in cui si è evoluto, e ogni specie oltre quel nodo lo eredita.

Come scrivere l’annidamento

Il generatore legge la stessa notazione con le parentesi del generatore di alberi filogenetici: racchiudi i due parenti più stretti tra parentesi, poi racchiudi quel gruppo con il parente successivo, e così via verso l’esterno. (Squalo,(Lucertola,(Topo,Uomo))); è lo squalo più un clade, quel clade è la lucertola più un clade più piccolo e la coppia più interna è topo e uomo. Se preferisci non scrivere parentesi, digita una specie per riga; lo strumento accoppia allora i vicini in un albero bilanciato, quindi Uomo, Scimpanzé, Gorilla diventa ((Uomo,Scimpanzé),Gorilla) e puoi riordinare i nomi finché la ramificazione corrisponde ai tuoi dati.

Come usare il generatore di cladogrammi

Domande frequenti

Che cos'è un cladogramma?

Un cladogramma è un diagramma ramificato delle relazioni evolutive. Ogni nodo rappresenta un antenato comune, e gli organismi che discendono da esso formano un clade. Mostra l'ordine in cui i lignaggi si sono separati, non quanto tempo fa né quanto sono cambiati.

Come faccio un cladogramma da una lista di specie?

Scrivi una specie per riga e il generatore accoppia i vicini in un albero bilanciato, oppure scrivi tu stesso l'annidamento con le parentesi: (Squalo,(Lucertola,(Topo,Uomo))); mette topo e uomo più vicini, poi la lucertola e lo squalo sul ramo più esterno.

Che cos'è un clade?

Un clade è un antenato insieme a tutti i suoi discendenti, un ramo completo del cladogramma. I mammiferi sono un clade; i rettili nella definizione tradizionale non lo sono, perché gli uccelli discendono dallo stesso antenato ma sono lasciati fuori.

Qual è la differenza tra un cladogramma e un albero filogenetico?

Un cladogramma mostra solo l'ordine delle ramificazioni, quindi tutti i suoi rami possono essere disegnati della stessa lunghezza. Un filogramma è un albero filogenetico i cui rami hanno lunghezze proporzionali al tempo o alla quantità di cambiamento genetico. Aggiungi una lunghezza dopo ogni nome, per esempio Uomo:0.6, e il generatore di alberi filogenetici lo disegna in scala.

Posso scaricare il cladogramma?

Sì. Scaricalo in PNG o JPG per una scheda di lavoro o una diapositiva, oppure in SVG per modificare etichette e colori in qualsiasi programma vettoriale. Il pulsante di condivisione copia un link che riapre lo stesso albero.