Arbre

Newick : regroupez les espèces apparentées entre parenthèses ; ajoutez :0.5 après un nom pour une longueur de branche. Ou listez simplement les espèces, une par ligne.

Newick

Créateur de cladogramme

Tapez une liste d’espèces ou un groupe emboîté écrit avec des parenthèses et ce créateur de cladogramme dessine aussitôt le diagramme en arbre : chaque organisme sur sa propre extrémité, chaque ancêtre partagé sur un nœud, prêt à télécharger en PNG ou SVG. Il est conçu pour les cours de biologie, où la question est généralement de savoir qui est le plus proche parent de qui, pas il y a combien de millions d’années ils se sont séparés.

Ce que montre un cladogramme

Un cladogramme est une hypothèse sur les relations évolutives. En lisant depuis la racine, chaque nœud est l’ancêtre commun le plus récent de tout ce qui se trouve à sa droite, et le groupe qui descend d’un nœud est un clade. Deux espèces qui se rejoignent à un nœud proche des extrémités sont de proches parentes ; une espèce dont la branche quitte le tronc en premier est le groupe externe. Les longueurs de branche n’ont ici aucun sens, seul l’ordre des séparations compte, ce qui explique qu’un cladogramme puisse être redessiné avec n’importe quel espacement sans changer ce qu’il dit.

Caractères dérivés partagés

Les biologistes placent les organismes sur un cladogramme d’après les caractères qu’ils partagent avec un ancêtre commun mais pas avec les lignées antérieures, appelés caractères dérivés partagés ou synapomorphies. L’arbre d’exemple fait exactement cela pour les vertébrés : la lamproie se détache en premier parce qu’elle n’a pas de mâchoires ; le requin a des mâchoires mais pas de squelette osseux ; le saumon ajoute l’os ; le lézard ajoute quatre membres et un œuf à coquille ; et la souris et l’humain sont ensemble sur le dernier nœud parce que tous deux ont des poils et nourrissent leurs petits de lait. Chaque caractère apparaît une fois, au nœud où il a évolué, et chaque espèce au-delà de ce nœud en hérite.

Comment écrire l’emboîtement

L’outil lit la même notation à parenthèses que le créateur d’arbre phylogénétique : entourez les deux parents les plus proches de parenthèses, puis entourez ce groupe avec le parent suivant, et ainsi de suite vers l’extérieur. (Requin,(Lézard,(Souris,Humain))); est le requin plus un clade, ce clade est le lézard plus un clade plus petit, et la paire la plus interne est la souris et l’humain. Si vous préférez ne pas écrire de parenthèses du tout, tapez une espèce par ligne ; l’outil apparie alors les voisines en un arbre équilibré, si bien que Humain, Chimpanzé, Gorille devient ((Humain,Chimpanzé),Gorille) et vous pouvez réordonner les noms jusqu’à ce que l’embranchement corresponde à vos données.

Utiliser le créateur de cladogramme

Questions fréquentes

Qu'est-ce qu'un cladogramme ?

Un cladogramme est un diagramme en arbre des relations évolutives. Chaque nœud représente un ancêtre commun, et les organismes qui en descendent forment un clade. Il montre l'ordre dans lequel les lignées se sont séparées, pas depuis combien de temps ni à quel point elles ont changé.

Comment faire un cladogramme à partir d'une liste d'espèces ?

Tapez une espèce par ligne et l'outil apparie les voisines en un arbre équilibré, ou écrivez vous-même l'emboîtement avec des parenthèses : (Requin,(Lézard,(Souris,Humain))); place la souris et l'humain au plus près, le lézard ensuite et le requin sur la branche la plus externe.

Qu'est-ce qu'un clade ?

Un clade est un ancêtre avec tous ses descendants, une branche complète du cladogramme. Les mammifères sont un clade ; les reptiles au sens traditionnel n'en sont pas un, parce que les oiseaux descendent du même ancêtre mais en sont exclus.

Quelle est la différence entre un cladogramme et un arbre phylogénétique ?

Un cladogramme ne montre que l'ordre des embranchements, donc toutes ses branches peuvent être dessinées à la même longueur. Un phylogramme est un arbre phylogénétique dont les longueurs de branche sont proportionnelles au temps ou à la quantité de changement génétique. Ajoutez une longueur après chaque nom, comme Humain:0.6, et le créateur d'arbre phylogénétique le dessine à l'échelle.

Puis-je télécharger le cladogramme ?

Oui. Téléchargez-le en PNG ou JPG pour une fiche ou une diapositive, ou en SVG pour modifier les étiquettes et les couleurs dans n'importe quel logiciel vectoriel. Le bouton de partage copie un lien qui rouvre le même arbre.