Newick: agrupe espécies aparentadas entre parênteses; adicione :0.5 depois de um nome para o comprimento do ramo. Ou apenas liste as espécies, uma por linha.
Cole um texto Newick ou simplesmente liste suas espécies uma por linha, e este criador de árvore filogenética desenha uma árvore evolutiva limpa no seu navegador: nós para os ancestrais comuns, pontas para as espécies e um resumo de uma linha com quantas espécies e pontos de ramificação a árvore tem. Mude para a visualização com comprimentos de ramo para ver a divergência em escala, depois baixe o desenho em PNG, JPG ou SVG. É um gerador de árvores filogenéticas para dever de casa, slides e artigos, sem conta e sem nada para instalar.
Newick é o formato de texto que todo programa de filogenética lê. As espécies que compartilham um ancestral vão entre parênteses, os grupos se aninham dentro de grupos, e um ponto e vírgula encerra a árvore. (((Humano,Chimpanzé),Gorila),Orangotango); diz que humano e chimpanzé se separaram mais recentemente, o gorila se ramificou antes deles e o orangotango primeiro de todos. Os nomes podem vir entre aspas ou usar sublinhados no lugar de espaços, e um rótulo escrito depois de um parêntese de fechamento dá nome a esse ancestral.
Uma lista simples é mais rápida quando você só conhece a ordem de parentesco. Digite as espécies uma por linha, com os parentes mais próximos lado a lado, e o criador emparelha os vizinhos numa árvore balanceada. Cinco nomes dão uma árvore com quatro pontos de ramificação; o texto Newick gerado aparece abaixo da entrada para que você ajuste o agrupamento à mão.
Acrescente :0.6 depois de um nome ou de um grupo para dar a esse ramo um comprimento, medido em substituições por sítio, milhões de anos ou o que quer que seus dados usem. Quando todo ramo tem um comprimento, o botão Comprimentos aparece acima da árvore. Nessa visualização cada espécie fica à sua distância total da raiz, então uma ponta bem à direita mudou mais, e duas pontas alinhadas divergiram pelo mesmo tempo. Sem comprimentos a árvore é um cladograma: só a ordem das ramificações tem significado, e as pontas se alinham.
Uma árvore com n espécies tem n − 1 pontos de ramificação quando toda divisão é em dois. Três ou mais espécies pendendo de um mesmo nó, (A,B,C), formam uma politomia, uma divisão não resolvida que o criador desenha como um leque.
A árvore é desenhada em SVG, então os downloads em PNG e JPG são renderizados em resolução dupla para slides e folhas de exercícios, e o arquivo SVG abre no Inkscape ou no Illustrator para edição. O botão de compartilhar copia um link que contém o texto Newick, e a mesma árvore abre para quem o seguir. Para uma árvore que mostra relações sem nenhum comprimento, o criador de cladograma começa com um exemplo clássico de vertebrados.
Coloque as espécies que compartilham um ancestral comum entre parênteses, separe-as com vírgulas e termine com ponto e vírgula: ((Humano,Chimpanzé),Gorila); significa que humano e chimpanzé são os mais próximos e o gorila se junta a eles em seguida. Acrescente dois-pontos e um número depois de um nome ou de um grupo para o comprimento do ramo, como em Humano:0.6.
Um cladograma mostra apenas a ordem das ramificações, então todas as pontas se alinham à direita. Um filograma desenha cada ramo em escala com seu comprimento, que representa tempo ou quantidade de mudança genética. O criador desenha um cladograma por padrão e oferece a visualização com comprimentos de ramo quando todos os ramos têm comprimento.
Sim. Digite uma espécie por linha e a ferramenta emparelha nomes vizinhos numa árvore balanceada. Ordene a lista de modo que as espécies que você quer agrupar fiquem uma ao lado da outra, depois edite o texto Newick gerado para refinar a ramificação.
Um ponto azul é um nó, o ancestral comum mais recente de tudo o que está à sua direita. Um ponto verde é uma ponta, uma das espécies que você digitou. Qualquer rótulo escrito depois de um parêntese de fechamento aparece ao lado do seu nó como nome do grupo.
Escolha PNG ou JPG para slides e documentos, ou SVG para editar num programa vetorial, e toque em Baixar. O botão de compartilhar copia um link que carrega o texto da árvore, então a mesma árvore abre para quem o seguir.